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    科學家在大豆進化研究中取得進展

    2017-09-28 15:46 | 作者: 昆明動物研究所 遺傳與發育生物學研究所 | 標簽: 大豆進化

    大豆是人類和動物油脂和蛋白質的主要來源,現代栽培大豆大約在5000年前由其近親野生大豆馴化,繼而進一步選育而成。鑒定大豆基因組中受馴化和改良的基因對指導大豆育種具有重要意義。

    中國科學院昆明動物研究所研究員王文課題組與中國科學院遺傳與發育生物學研究所田志喜課題組聯合攻關,對302份代表性大豆種質進行了深度重測序(>10x)和基因組分析,結果表明大豆在馴化和改良過程中遺傳多態性明顯降低,暗示大豆具有明顯的選擇瓶頸效應。利用XP-CLR方法在馴化階段(野生大豆—>農家種)鑒定出121個強選擇信號,在品種改良階段(農家種—>栽培品種)鑒定出109個強選擇信號。為了明確這些選擇信號所對應的性狀,對種子大小、種皮顏色、生長習性、油含量等性狀做了全基因組關聯(GWAS)分析,找出一系列顯著關聯位點。進而把選擇信號、GWAS信號以及前人研究的油含量QTLs相整合,發現很多選擇信號和油相關的性狀有關,說明大豆產油性狀受人工選擇較多,形成復雜的網絡系統共同調控油的代謝,從而引起不同種質油相關性狀的變異。

    研究還定位了一些重要農藝性狀的調控位點,并且明確了一些基因在區域化選擇中的作用,例如控制花周期的E1,控制生長習性的Dt1,控制絨毛顏色的T等。這為大豆重要農藝性狀調控網絡的研究奠定了重要基礎。

    該研究結果于2月3日在線發表于Nature Biotechnology 雜志。田志喜課題組周正奎、王正、李瑋瑜和王文課題組姜雨、呂俊、茍志恒為該論文的共同第一作者,田志喜和王文為共同通訊作者。

    該研究得到了科技部“973”項目、國家自然科學基金委、中科院戰略性先導專項(A類)等項目的資助。

    文章鏈接:http://www.nature.com/nbt/journal/vaop/ncurrent/full/nbt.3096.html

    來源:中科院

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